蒙药的产生和发展，如同祖国医学的发展一样经历了长期的实践过程。蒙古族人民常年在辽阔的草原上过着游牧、狩猎的生活，因而与自然界的各种物质广泛接触，逐步发现、了解到某些 植物、动物、矿物及泉水对人体可能产生影响，其中包括一些中毒现象，从而逐渐对所寻觅的食物有所辨别和选择。为了同疾病作斗争，开始注意某些自然产物的治病作用和毒性作用。经过无数次的有意识的试用和观察，包括口尝身受，实际体验反复应用于各种疾病的治疗，不断总结提高，创造和积累了日益丰富的用药知识。　　 　　
　　在科学文化未发达的氏族社会和奴隶社会时期，蒙古各部落的药物知识均被萨满教徒所掌握，公元10世纪末 ，蒙古各部落述渐强盛起来，随着成吉思汗统一蒙古进入封建社会，蒙古民族与国内务兄弟民族之间的文化交流得以开展，在此影响下，当时处于萌芽阶段的蒙药知识也有了新的发展，据史书记载，公元1226年在蒙古军营中瘟病流行就有曾用格西古纳(大黄)治愈的实例。